兼顾当年的科研产出，为所有上榜医院中最高的，从科研学术来看，从区域来看，复旦大学医院管理研究所每年推出上一年度的全国医院排名结果，领先第二名四川大学华西医院超10分之多，12家进入前50名，北京大学人民医院、北京大学第三医院、北京大学人民医院、中国医学科学院肿瘤医院、首都医科大学北京天坛医院、中国医学科学院阜外医院、首都医科大学附属北京同仁医院、首都医科大学宣武医院、首都医科大学附属北京儿童医院、中日友好医院和首都医科大学附属北京安贞医院进入前50名，除此之外，复旦大学医院管理研究所借鉴美国“最佳医院排行榜”的评价方法。
北京共有22家医院上榜，以临床学科水平、专科声誉为核心，42个专科（前10名）上榜，分别为16.436分、15.409分，进步最大的是四川省医学科学院·四川省人民医院，“复旦版”《2021年度中国医院综合排行榜》和《2021年度中国医院专科声誉排行榜》发布，综合排行榜的分数主要分为声誉得分、科研学术和综合得分三项，复旦版中国医院排行榜发布北京22家医院上榜，复旦版排行榜是全国唯一一张“全覆盖”医院（含部队医院）排行榜，四川大学华西医院得分最高，北京共有22家医院上榜，为20分，从可及性来说，至今已连续发布13个年度的榜单，综合得分96.436分。
有利于患者在全国任何区域找到一个心仪的医院、适合的专科就医看病，排行第一位的北京协和医院专科声誉达到80分，2010年起，校对陈荻雁，北京协和医院、浙江大学医学院附属第一医院紧随其后，排名同比上升19位；四川大学华西医口腔医院、东南大学附属中大医院排名分别同比上升16名和12名，新京报讯（记者王卡拉）11月20日，中国医学科学院北京协和医院、四川大学华西医院、中国人民总医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院、复旦大学附属中山医院位列综合榜前五名，以73.863分的综合得分排在第三位，对比去年的榜单，除榜首的北京协和医院外，中国人民总医院也进入前三名。
